Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBXN1Q04323 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBXN1Q04323 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms