Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLOD1Q02809 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLOD1Q02809 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms