Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC6A3Q01959 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC6A3Q01959 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms