Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFKB2Q00653 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFKB2Q00653 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms