Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLTCQ00610 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLTCQ00610 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms