Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TFAMQ00059 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TFAMQ00059 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms