Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP46P62068 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP46P62068 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP46P62068 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP46P62068 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
USP46P62068 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP46P62068 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
USP46P62068 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP46P62068 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP46P62068 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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