Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FAM3BP58499 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FAM3BP58499 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms