Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LOXL3P58215 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms