Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
STX17P56962 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
STX17P56962 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX17P56962 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX17P56962 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX17P56962 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX17P56962 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX17P56962 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX17P56962 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
STX17P56962 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
STX17P56962 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
STX17P56962 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
STX17P56962 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
STX17P56962 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
STX17P56962 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms