Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TPTEP56180 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TPTEP56180 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms