Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL23P55773 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL23P55773 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCL23P55773 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCL23P55773 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCL23P55773 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCL23P55773 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCL23P55773 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms