Protein–RNA interactions for Protein: P55316

FOXG1, Forkhead box protein G1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXG1P55316 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FOXG1P55316 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms