Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.322e-6■■■■□ 25.7
HNRNPMP52272 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.982e-6■■■■□ 25.7
HNRNPMP52272 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.612e-6■■■■□ 25.7
HNRNPMP52272 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.472e-6■■■■□ 25.7
HNRNPMP52272 FAM172A-202ENST00000502503 1392 ntTSL 215.01□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 25.7
HNRNPMP52272 FAM172A-201ENST00000395965 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.492e-6■■■■□ 25.7
HNRNPMP52272 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-6■■■■□ 25.7
HNRNPMP52272 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.111e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.641e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.071e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -11e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.366e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.064e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.054e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.664e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.574e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.124e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.114e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-217ENST00000602700 2533 ntTSL 228.18■■■□□ 2.14e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-218ENST00000602713 2606 ntTSL 227.03■■□□□ 1.924e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.854e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-207ENST00000422590 2939 ntTSL 1 (best)26.43■■□□□ 1.824e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-203ENST00000366632 2525 ntTSL 226.04■■□□□ 1.764e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.654e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.654e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-219ENST00000602822 2691 ntTSL 225.37■■□□□ 1.654e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-201ENST00000295051 2706 ntTSL 224.87■■□□□ 1.574e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.744e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 TSNAX-DISC1-203ENST00000602885 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 218.81■□□□□ 0.64e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.454e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.314e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 DISC1-211ENST00000535944 2940 ntTSL 216.49■□□□□ 0.234e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 TSNAX-DISC1-204ENST00000602956 3294 ntAPPRIS P5 TSL 215.06■□□□□ 04e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 TSNAX-DISC1-202ENST00000602634 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.05■□□□□ 04e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 TSNAX-DISC1-205ENST00000602962 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.224e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 TSNAX-DISC1-201ENST00000602567 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.32□□□□□ -0.444e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ADGRA3-208ENST00000506346 453 ntTSL 335.77■■■■□ 3.329e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.139e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ADGRA3-211ENST00000513385 538 ntTSL 47.43□□□□□ -1.229e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 BAGE2-201ENST00000470054 1891 ntTSL 1 (best)22.63■■□□□ 1.211e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 SCYL2-204ENST00000548392 790 ntTSL 424.89■■□□□ 1.587e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.457e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 SCYL2-207ENST00000549687 2328 ntTSL 218.68■□□□□ 0.587e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.497e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 520.32■□□□□ 0.841e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 AKAP10-201ENST00000225737 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.248e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 AKAP10-202ENST00000395536 1815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.18e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.975e-10■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.477e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.66■■■■□ 3.944e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.781e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ZNF652-203ENST00000508237 4543 ntTSL 217.36■□□□□ 0.371e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.921e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.586e-8■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 APLP2-219ENST00000533616 2041 ntTSL 227.92■■■□□ 2.066e-8■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.736e-8■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.526e-8■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.356e-8■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.256e-8■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 LRRC40-201ENST00000370952 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.423e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 MAD1L1-209ENST00000438959 839 ntTSL 321.85■■□□□ 1.099e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.372e-10■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 FAM107B-208ENST00000452706 834 ntTSL 210.32□□□□□ -0.762e-10■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 FAM107B-210ENST00000468492 625 ntTSL 410.32□□□□□ -0.762e-10■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 FAM107B-227ENST00000495292 542 ntTSL 410.32□□□□□ -0.762e-10■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.532e-10■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.542e-10■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.131e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 240.73■■■■■ 4.111e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 532.4■■■□□ 2.781e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-229ENST00000492127 1153 ntTSL 232.26■■■□□ 2.751e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 231.72■■■□□ 2.671e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.531e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.411e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.371e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-218ENST00000450497 882 ntTSL 529.14■■■□□ 2.261e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 428.43■■■□□ 2.141e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.741e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-208ENST00000423004 773 ntTSL 225.71■■□□□ 1.711e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-228ENST00000487962 2024 ntTSL 224.69■■□□□ 1.541e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.281e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.851e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 318.75■□□□□ 0.591e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 315.61■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 LINC01060-202ENST00000503580 418 ntTSL 320.6■□□□□ 0.891e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 LINC01060-204ENST00000510832 2435 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 LINC01060-203ENST00000510005 468 ntTSL 25.06□□□□□ -1.61e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 LINC01060-201ENST00000503458 375 ntTSL 33.1□□□□□ -1.911e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 RALGAPA1-206ENST00000554259 3354 ntTSL 53.5□□□□□ -1.851e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 217.78■□□□□ 0.441e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)17.01■□□□□ 0.311e-6■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 TEAD1-204ENST00000527376 477 ntTSL 334.18■■■■□ 3.064e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ATP2A2-203ENST00000377685 5702 ntTSL 526.85■■□□□ 1.891e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.381e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.911e-7■■■■□ 25.6
HNRNPMP52272 ZNF235-205ENST00000591609 946 ntTSL 429.78■■■□□ 2.361e-6■■■■□ 25.5
HNRNPMP52272 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.91e-6■■■■□ 25.5
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 223.2 ms