Protein–RNA interactions for Protein: P50991

CCT4, T-complex protein 1 subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT4P50991 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT4P50991 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT4P50991 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT4P50991 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT4P50991 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT4P50991 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT4P50991 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT4P50991 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCT4P50991 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCT4P50991 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT4P50991 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT4P50991 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT4P50991 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT4P50991 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT4P50991 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT4P50991 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT4P50991 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT4P50991 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms