Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ERFP50548 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ERFP50548 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ERFP50548 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ERFP50548 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERFP50548 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERFP50548 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERFP50548 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms