Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX1P48742 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX1P48742 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX1P48742 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX1P48742 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX1P48742 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX1P48742 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX1P48742 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX1P48742 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX1P48742 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX1P48742 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms