Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF4P48230 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM4SF4P48230 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms