Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
RPL28P46779 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPL28P46779 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
RPL28P46779 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPL28P46779 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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RPL28P46779 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
RPL28P46779 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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