Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP5P45974 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
USP5P45974 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
USP5P45974 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
USP5P45974 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
USP5P45974 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
USP5P45974 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
USP5P45974 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms