Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NCAPD3P42695 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC36.43■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NCAPD3P42695 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCAPD3P42695 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCAPD3P42695 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCAPD3P42695 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
NCAPD3P42695 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCAPD3P42695 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCAPD3P42695 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NCAPD3P42695 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms