Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PIK3CBP42338 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PIK3CBP42338 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms