Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOBEC1P41238 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
APOBEC1P41238 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms