Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT2P35908 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT2P35908 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT2P35908 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT2P35908 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT2P35908 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT2P35908 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT2P35908 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT2P35908 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT2P35908 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms