Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYH11P35749 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYH11P35749 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYH11P35749 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYH11P35749 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYH11P35749 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYH11P35749 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYH11P35749 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYH11P35749 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYH11P35749 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYH11P35749 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms