Protein–RNA interactions for Protein: P34219

TOD6, Transcriptional regulatory protein TOD6, yeastyeast

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TOD6P34219 SMD1YGR074W 441 nt3.08□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt3.08□□□□□ -1.92
TOD6P34219 TRM7YBR061C 933 nt3.08□□□□□ -1.92
TOD6P34219 KEL2YGR238C 2649 nt3.08□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YMR317WYMR317W 3423 nt3.07□□□□□ -1.92
TOD6P34219 RPS27BYHR021C 249 nt3.07□□□□□ -1.92
TOD6P34219 STT4YLR305C 5703 nt3.07□□□□□ -1.92
TOD6P34219 MSR1YHR091C 1932 nt3.07□□□□□ -1.92
TOD6P34219 PUF6YDR496C 1971 nt3.07□□□□□ -1.92
TOD6P34219 HDA3YPR179C 1968 nt3.07□□□□□ -1.92
TOD6P34219 AKR1YDR264C 2295 nt3.06□□□□□ -1.92
TOD6P34219 FAR1YJL157C 2493 nt3.06□□□□□ -1.92
TOD6P34219 VID27YNL212W 2349 nt3.06□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YOR376WYOR376W 369 nt3.06□□□□□ -1.92
TOD6P34219 BRO1YPL084W 2535 nt3.06□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YPR014CYPR014C 330 nt3.06□□□□□ -1.92
TOD6P34219 APC2YLR127C 2562 nt3.06□□□□□ -1.92
TOD6P34219 TOF2YKR010C 2316 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 NMA111YNL123W 2994 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YHR080CYHR080C 4038 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YDR426CYDR426C 378 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 GOT1YMR292W 417 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 snR52snR52 92 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 PFK26YIL107C 2484 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YDL176WYDL176W 2127 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 REC8YPR007C 2043 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 DIS3YOL021C 3006 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 TFB1YDR311W 1929 nt3.05□□□□□ -1.92
TOD6P34219 ECM5YMR176W 4236 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 PHD1YKL043W 1101 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 UPS1YLR193C 528 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 RPL38YLR325C 237 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 MRPL33YMR286W 261 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.04□□□□□ -1.92
TOD6P34219 FLO10YKR102W 3510 nt3.03□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YLL007CYLL007C 1998 nt3.03□□□□□ -1.92
TOD6P34219 LCD1YDR499W 2244 nt3.03□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.03□□□□□ -1.92
TOD6P34219 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt3.03□□□□□ -1.92
TOD6P34219 KAP95YLR347C 2586 nt3.03□□□□□ -1.93
TOD6P34219 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 RCY1YJL204C 2523 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 CAF130YGR134W 3369 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 RBK1YCR036W 1002 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YDR544CYDR544C 429 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 APC9YLR102C 798 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YLR416CYLR416C 399 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YPR053CYPR053C 456 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 PDE2YOR360C 1581 nt3.02□□□□□ -1.93
TOD6P34219 CIN8YEL061C 3003 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YSP2YDR326C 4317 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 STE6YKL209C 3873 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YIL059CYIL059C 366 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 RPS27AYKL156W 249 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YBL065WYBL065W 345 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 snR191snR191 274 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 CIN1YOR349W 3045 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 LEU3YLR451W 2661 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 GYL1YMR192W 2163 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 GCD6YDR211W 2139 nt3.01□□□□□ -1.93
TOD6P34219 NCL1YBL024W 2055 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 ETP1YHL010C 1758 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 SLM2YNL047C 1971 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 PHM6YDR281C 315 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 POG1YIL122W 1056 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YMR326CYMR326C 309 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 RSM19YNR037C 276 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 RAD4YER162C 2265 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 PRP42YDR235W 1635 nt3□□□□□ -1.93
TOD6P34219 SEC5YDR166C 2916 nt2.99□□□□□ -1.93
TOD6P34219 TAO3YIL129C 7131 nt2.99□□□□□ -1.93
TOD6P34219 SKT5YBL061C 2091 nt2.99□□□□□ -1.93
TOD6P34219 SNU13YEL026W 381 nt2.99□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YMR324CYMR324C 243 nt2.99□□□□□ -1.93
TOD6P34219 RPS23BYPR132W 438 nt2.99□□□□□ -1.93
TOD6P34219 APL4YPR029C 2499 nt2.99□□□□□ -1.93
TOD6P34219 PEX8YGR077C 1770 nt2.98□□□□□ -1.93
TOD6P34219 SIP3YNL257C 3690 nt2.98□□□□□ -1.93
TOD6P34219 QCR7YDR529C 384 nt2.98□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YIL071W-AYIL071W-A 477 nt2.98□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YPR092WYPR092W 306 nt2.98□□□□□ -1.93
TOD6P34219 NUT2YPR168W 474 nt2.98□□□□□ -1.93
TOD6P34219 NPR1YNL183C 2373 nt2.98□□□□□ -1.93
TOD6P34219 CPA2YJR109C 3357 nt2.98□□□□□ -1.93
TOD6P34219 SQS1YNL224C 2304 nt2.97□□□□□ -1.93
TOD6P34219 SWA2YDR320C 2007 nt2.97□□□□□ -1.93
TOD6P34219 CHS2YBR038W 2892 nt2.97□□□□□ -1.93
TOD6P34219 CDC27YBL084C 2277 nt2.97□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt2.97□□□□□ -1.93
TOD6P34219 INA22YIR024C 651 nt2.97□□□□□ -1.93
TOD6P34219 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.9 ms