Protein–RNA interactions for Protein: P32487

LYP1, Lysine-specific permease, yeast

Predictions only

Length 611 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LYP1	P32487	RGR1	YLR071C	3249 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	PSF1	YDR013W	627 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	tF(GAA)D	tF(GAA)D	73 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	tF(GAA)N	tF(GAA)N	73 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YGL014C-A	YGL014C-A	162 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YGR069W	YGR069W	336 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	DLS1	YJL065C	504 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	GIS2	YNL255C	462 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YPR099C	YPR099C	357 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	AKR1	YDR264C	2295 nt		3.17	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YEL025C	YEL025C	3567 nt		3.16	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	SKP2	YNL311C	2292 nt		3.16	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	YER079C-A	YER079C-A	339 nt		3.16	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	RLI1	YDR091C	1827 nt		3.16	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	DNL4	YOR005C	2835 nt		3.15	□□□□□ -1.9
LYP1	P32487	SNT1	YCR033W	3681 nt		3.15	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	snR80	snR80	171 nt		3.15	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YDL211C	YDL211C	1119 nt		3.15	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YDR048C	YDR048C	315 nt		3.15	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RPS27A	YKL156W	249 nt		3.15	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	APC9	YLR102C	798 nt		3.15	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	MF(ALPHA)1	YPL187W	498 nt		3.15	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.15	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	SHQ1	YIL104C	1524 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	TSC11	YER093C	4293 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YDL025W-A	YDL025W-A	105 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YMR046W-A	YMR046W-A	129 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	LSM7	YNL147W	348 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RTC6	YPL183W-A	282 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	MPH1	YIR002C	2982 nt		3.14	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	NAB3	YPL190C	2409 nt		3.13	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		3.13	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	ROG1	YGL144C	2058 nt		3.13	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	IKI3	YLR384C	4050 nt		3.13	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.13	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RAD2	YGR258C	3096 nt		3.12	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	NCL1	YBL024W	2055 nt		3.12	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	MBB1	YJL199C	327 nt		3.12	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RPS21A	YKR057W	264 nt		3.12	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	GRX8	YLR364W	330 nt		3.12	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	CHO2	YGR157W	2610 nt		3.12	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	NET1	YJL076W	3570 nt		3.12	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	STU2	YLR045C	2667 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	FLO1	YAR050W	4614 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RBK1	YCR036W	1002 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	ALG13	YGL047W	609 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YIL102C	YIL102C	306 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YMR122W-A	YMR122W-A	255 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RPL20A	YMR242C	519 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	KSP1	YHR082C	3090 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	SPO71	YDR104C	3738 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	DBP6	YNR038W	1890 nt		3.11	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	PTC5	YOR090C	1719 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	STE6	YKL209C	3873 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YTA7	YGR270W	4140 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	CDC36	YDL165W	576 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YPR089W	YPR089W	2667 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	DOT6	YER088C	2013 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	SGD1	YLR336C	2700 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	FRE2	YKL220C	2136 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RSN1	YMR266W	2862 nt		3.1	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YDL062W	YDL062W	426 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YIL059C	YIL059C	366 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	PHS1	YJL097W	654 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	YJL222W-B	YJL222W-B	138 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	COA4	YLR218C	453 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	RPL36A	YMR194W	303 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	MRPL33	YMR286W	261 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	SAR1	YPL218W	573 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	CIN8	YEL061C	3003 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	UBP11	YKR098C	2154 nt		3.09	□□□□□ -1.91
LYP1	P32487	ARP7	YPR034W	1434 nt		3.09	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YMR317W	YMR317W	3423 nt		3.09	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	KAP104	YBR017C	2757 nt		3.08	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	POL2	YNL262W	6669 nt		3.08	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YDR406W-A	YDR406W-A	246 nt		3.08	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YGL007C-A	YGL007C-A	87 nt		3.08	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	DAD3	YBR233W-A	285 nt		3.08	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	snR49	snR49	165 nt		3.08	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	RIF1	YBR275C	5751 nt		3.08	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	PRP6	YBR055C	2700 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	MET6	YER091C	2304 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YEL020C-B	YEL020C-B	198 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	tK(UUU)D	tK(UUU)D	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	tK(UUU)G1	tK(UUU)G1	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	tK(UUU)G2	tK(UUU)G2	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	tK(UUU)K	tK(UUU)K	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	tK(UUU)L	tK(UUU)L	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	tK(UUU)O	tK(UUU)O	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	tK(UUU)P	tK(UUU)P	73 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YHL041W	YHL041W	450 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YLR053C	YLR053C	327 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	GOT1	YMR292W	417 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YBL065W	YBL065W	345 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YOR008C-A	YOR008C-A	225 nt		3.07	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	RAD61	YDR014W	1944 nt		3.06	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	YIL032C	YIL032C	357 nt		3.06	□□□□□ -1.92
LYP1	P32487	DBP7	YKR024C	2229 nt		3.06	□□□□□ -1.92

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