Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA11P31270 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA11P31270 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms