Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SRIP30626 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRIP30626 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRIP30626 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRIP30626 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms