Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRMP28827 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRMP28827 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
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