Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLD1P28340 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
POLD1P28340 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLD1P28340 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLD1P28340 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLD1P28340 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLD1P28340 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
POLD1P28340 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLD1P28340 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms