Protein–RNA interactions for Protein: P28068

HLA-DMB, HLA class II histocompatibility antigen, DM beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMBP28068 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HLA-DMBP28068 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DMBP28068 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HLA-DMBP28068 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMBP28068 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMBP28068 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMBP28068 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMBP28068 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMBP28068 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-DMBP28068 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms