Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ITGA6P23229 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ITGA6P23229 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms