Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CASTP20810 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CASTP20810 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CASTP20810 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CASTP20810 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CASTP20810 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASTP20810 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASTP20810 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms