Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
XBP1P17861 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
XBP1P17861 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
XBP1P17861 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
XBP1P17861 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XBP1P17861 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XBP1P17861 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
XBP1P17861 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
XBP1P17861 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms