Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CD44P16070 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CD44P16070 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CD44P16070 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CD44P16070 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CD44P16070 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CD44P16070 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms