Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BMP3P12645 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BMP3P12645 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BMP3P12645 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BMP3P12645 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BMP3P12645 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BMP3P12645 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BMP3P12645 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BMP3P12645 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BMP3P12645 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms