Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RLBP1P12271 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RLBP1P12271 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms