Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COL6A2P12110 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL6A2P12110 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms