Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GLI4P10075 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GLI4P10075 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI4P10075 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI4P10075 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI4P10075 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GLI4P10075 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GLI4P10075 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms