Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CGB3P0DN86 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms