Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PGA3P0DJD8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PGA3P0DJD8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms