Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD1P0DJD0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RGPD1P0DJD0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms