Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMIM6P0DI80 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms