Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR29P0C7W0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR29P0C7W0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms