Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYP3A4P08684 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CYP3A4P08684 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms