Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SRPRAP08240 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms