Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SCG5P05408 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SCG5P05408 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SCG5P05408 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SCG5P05408 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms