Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDN1P05305 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDN1P05305 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDN1P05305 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDN1P05305 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDN1P05305 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDN1P05305 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDN1P05305 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDN1P05305 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDN1P05305 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDN1P05305 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDN1P05305 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDN1P05305 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDN1P05305 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms