Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TIMP1P01033 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMP1P01033 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms